La mission du musée: susciter l’intérêt et l’émerveillement pour la nature et les sciences au moyen d’une diffusion dynamique et accessible à toute la collectivité et mettre en valeur des collections issues du patrimoine naturel. Le COMPTOIR-NATURE est un endroit unique et innovateur, où les membres du musée viennent emprunter des éléments de la nature et acquérir des connaissances sur le monde naturel. Cette « bibliothèque de la nature » permet aux jeunes citoyens de s’approprier, pour un certain temps, une partie de la nature et, par ce fait même, de découvrir différents aspects de la nature.